河道断面单一对生物多样性造成影响，在自然的河流横断面上，浅滩与深潭相间，是生物群落的栖息生长之地，而改造过后的河床常用输水性能好又便于施工的梯形等单一且规则的断面型式，使得水流流速均一化，破坏了原有河道多样性的特征。
而河流形态多样性是生物物种多样性的前提，河流形态的规则化、单一化，在不同程度上对生物多样性造成严重影响。
长期以来，传统的河道石笼网护岸工程往往局限于防洪、排涝、引水和航运等基本功能。
在护岸工程设计中，特别是城市河道，为了控制河势和确保河道的防洪安全，着力于运用块石、混凝土等硬质材料的结构设计，而很少考虑河道的生态、景观、休闲、娱乐等其他功能。
现行城市防洪工程设计规范，也未明确提出河道石笼网护岸的生态学要求，致使不少地方的河道，被人为渠化及对河岸的强行硬化。
这样一来，对河道和人类造成了诸多方面的负面影响。
现阶段河道石笼网护岸对生态环境的影响？生物多样性严重受损。
河流护坡工程引起了河道流量和流速的变化。
水流行进过程的变化等，从而造成许多生物栖息环境的改变甚至消失；河床硬化覆盖阻断了城市地下水补给。
封闭式的护坡结构完全隔断了地下水与土壤的联系，以致阻滞了地下水补给；河岸衬砌硬化之后，原始河岸面目全非，土体与水体的关系相割裂，隔断了河道水域中的生物、微生物与陆域的接触，并引起其自然生存环境恶化，河流的天然自净能力因此下降。
同时，硬化型河岸使得水生植物无法生长，各种水生动物也因生存环境改变而无法生存，整个生态系统的食物链因硬化河岸而断开，河流生态廊道的作用因此失去，河流生态系统的整体平衡遭到破坏，并由此诱发严重的生态环境问题。
对人类生活环境的影响河道两岸修筑防洪堤岸并实施硬化护坡之后，洪涝灾害的发生频率和强度明显增加。
